INFO OBAT INDONESIA

Penyebab Infeksi Virus Corona Covid19

Penyebab Infeksi Virus Corona Covid19

Widodo judarwanto, Audi Yudhasmara, Sandiaz

Sebuah coronavirus baru, yang ditunjuk 2019-nCoV,  pertama kali diidentifikasi di Wuhan, provinsi Hubei, Cina, setelah orang mengembangkan pneumonia tanpa sebab yang jelas dan yang vaksin atau perawatan yang ada tidak efektif. Virus ini telah menunjukkan bukti penularan dari manusia ke manusia dan laju penularannya (tingkat infeksi) tampaknya meningkat pada pertengahan Januari 2020, dengan beberapa negara di seluruh Eropa, Amerika Utara dan pelaporan Asia-Pasifik kasus. Masa inkubasi (waktu mulai dari paparan gejala yang berkembang) dari virus adalah antara 2 dan 10 hari dan tetap menular selama masa ini.  Gejalanya meliputi demam, batuk, dan kesulitan bernapas, dan bisa berakibat fatal.

Pada 28 Januari 2020, sekitar 6.061 kasus telah dikonfirmasi termasuk di setiap provinsi di Tiongkok kecuali Wilayah Otonomi Tibet. Kematian dikonfirmasi pertama dari infeksi coronavirus terjadi pada 9 Januari dan sejak itu 132 kematian telah dikonfirmasi, dengan tingkat kematian kasus 2,2%.  Studi epidemiologis memperkirakan bahwa sejumlah besar orang mungkin telah terinfeksi, tetapi tidak terdeteksi.

Otoritas kesehatan Tiongkok adalah yang pertama memposting genom lengkap 2019-nCoV di GenBank ikon eksternal, basis data urutan genetik NIH, dan dalam Inisiatif Global tentang Berbagi Semua Data Influenza (GISAIDikon eksternal) portal, suatu tindakan yang telah memfasilitasi deteksi virus ini. CDC memposting genom lengkap dari virus 2019-nCoV yang terdeteksi pada pasien AS pertama dan kedua ke GenBank.

2019-nCoV adalah betacoronavirus, seperti MERS dan SAR, yang semuanya berasal dari kelelawar. Urutan dari pasien A.S. mirip dengan yang pertama kali diposting Cina, menunjukkan kemungkinan munculnya tunggal baru-baru ini dari reservoir hewan.
Pada awalnya, banyak pasien dalam wabah penyakit pernapasan yang disebabkan oleh 2019-nCov di Wuhan, Cina memiliki hubungan dengan makanan laut besar dan pasar hewan hidup, menunjukkan penyebaran dari hewan ke orang. Kemudian, semakin banyak pasien yang dilaporkan tidak memiliki paparan ke pasar hewan, menunjukkan penyebaran orang-ke-orang. Pejabat Tiongkok melaporkan bahwa penyebaran orang-ke-orang yang berkelanjutan di komunitas terjadi di Tiongkok.

Virus Corona

  • Virus Corona berasal dari keluarga Coronaviridae dan merupakan virus RNA beruntai tunggal, yang permukaannya ditutupi oleh proyeksi seperti mahkota, yang memberi nama virus itu. Virus ini menyebar melalui paparan droplet dan fomite. Sudah lama diketahui menyebabkan infeksi saluran pernapasan atas, virus corona tidak dirasakan secara signifikan menyebabkan pneumonia sampai akhir-akhir ini. Namun, pandemi sindrom pernapasan akut (SARS) yang parah pada tahun 2003 membawa kemampuan virus ini untuk menyebabkan pneumonia yang mengancam jiwa menjadi perhatian dunia.
  • Tujuh human coronavirus (HCoVs) sekarang telah diidentifikasi: HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARS-COV (yang menyebabkan sindrom pernapasan akut), MERS-COV (sindrom pernapasan Timur Tengah), dan 2019-nCoV. Semua kecuali 2019-nCoV tampaknya merupakan patogen manusia dengan distribusi di seluruh dunia, yang menyebabkan infeksi saluran pernapasan atas dan bawah, terutama pada anak-anak. Biasanya, infeksi HCoV mengikuti pola musiman yang serupa dengan influenza, meskipun peneliti Hong Kong menemukan bahwa infeksi HCoV-NL63 terutama terjadi pada awal musim panas dan musim gugur. Coronavirus baru (2019-nCoV) dilaporkan pada akhir 2019 dan awal 2020 di tengah sekelompok infeksi manusia di Cina.
  • CoV adalah virus RNA untai positif dengan penampilan seperti mahkota di bawah mikroskop elektron (coronam adalah istilah Latin untuk mahkota) karena adanya lonjakan glikoprotein pada amplop. Subfamili Orthocoronavirinae dari keluarga Coronaviridae (orde Nidovirales) digolongkan ke dalam empat gen CoV: Alphacoronavirus (alphaCoV), Betacoronavirus (betaCoV), Deltacoronavirus (deltaCoV), dan Gammacoronavirus (deltaCoV). Selanjutnya, genus betaCoV membelah menjadi lima sub-genera atau garis keturunan. [2] Karakterisasi genom telah menunjukkan bahwa mungkin kelelawar dan tikus adalah sumber gen alphaCoVs dan betaCoVs. Sebaliknya, spesies burung tampaknya mewakili sumber gen deltaCoVs dan gammaCoVs.
  • Anggota keluarga besar virus ini dapat menyebabkan penyakit pernapasan, enterik, hati, dan neurologis pada berbagai spesies hewan, termasuk unta, sapi, kucing, dan kelelawar. Sampai saat ini, tujuh CoV manusia (HCV) – yang mampu menginfeksi manusia – telah diidentifikasi. Beberapa HCoV diidentifikasi pada pertengahan 1960-an, sementara yang lain hanya terdeteksi pada milenium baru.
  • Secara umum, perkiraan menunjukkan bahwa 2% dari populasi adalah pembawa CoV yang sehat dan bahwa virus ini bertanggung jawab atas sekitar 5% hingga 10% dari infeksi pernapasan akut.
    • CoV manusia pada umumnya: HCoV-OC43, dan HCoV-HKU1 (betaCoVs dari garis keturunan A); HCoV-229E, dan HCoV-NL63 (alphaCoVs). Mereka dapat menyebabkan pilek dan infeksi pernafasan atas yang sembuh sendiri pada individu yang imunokompeten. Pada subjek yang mengalami gangguan kekebalan dan orang tua, infeksi saluran pernapasan bagian bawah dapat terjadi.
    • CoV manusia lainnya: SARS-CoV, SARS-CoV-2, dan MERS-CoV (betaCoVs dari garis keturunan B dan C, masing-masing). Ini menyebabkan epidemi dengan tingkat keparahan klinis bervariasi dengan manifestasi pernapasan dan ekstra-pernapasan. Mengenai SARS-CoV, MERS-CoV, angka kematian masing-masing hingga 10% dan 35%.
  • Dengan demikian, SARS-CoV-2 termasuk dalam kategori betaCoVs. Ini memiliki bentuk bulat atau elips dan sering pleomorfik, dan diameter sekitar 60-140 nm. Seperti CoV lainnya, ia sensitif terhadap sinar ultraviolet dan panas. Lebih lanjut, virus-virus ini dapat secara efektif dinonaktifkan oleh pelarut lipid termasuk eter (75%), etanol, desinfektan yang mengandung klorin, asam peroksiasetat dan kloroform kecuali untuk klorheksidin.
  • Dalam istilah genetik, Chan dkk telah membuktikan bahwa genom HCoV baru, yang diisolasi dari pasien cluster dengan pneumonia atipikal setelah mengunjungi Wuhan, memiliki 89% identitas nukleotida dengan kelelawar SARS-seperti-CoVZXC21 dan 82% dengan gen manusia SARS-CoV. Untuk alasan ini, virus baru itu bernama SARS-CoV-2. Genom RNA untai tunggal-nya mengandung 29891 nukleotida, yang mengkode 9860 asam amino. Meskipun asalnya tidak sepenuhnya dipahami, analisis genom ini menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 mungkin berevolusi dari strain yang ditemukan pada kelelawar. Namun, potensi mamalia yang memperkuat, perantara antara kelelawar dan manusia, belum diketahui. Karena mutasi pada strain asli bisa secara langsung memicu virulensi terhadap manusia, tidak pasti bahwa perantara ini ada.
Baca  Tindakan Berlebihan Saat Demam pada Anak

Genetika, asal-usul, reservoir, dan inang pengirim

Reservoir satwa liar alami 2019-nCoV dan hospes perantara yang mentransmisikan 2019-nCoV ke manusia belum dikonfirmasi, dan hasil pengambilan sampel hewan dari pasar belum tersedia.  Namun, kemungkinan reservoir utama untuk virus adalah kelelawar.

Sebuah penelitian yang diperbarui diterbitkan 23 Januari 2020 tentang bioRxiv dari anggota Institut Virologi Wuhan, rumah sakit Wuhan Jinyintan, Universitas Akademi Ilmu Pengetahuan Cina dan Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit Provinsi Hubei menyarankan bahwa coronavirus novel 2019 memiliki kemungkinan asal kelelawar, karena analisis mereka menunjukkan bahwa nCoV-2019 adalah 96% identik pada tingkat genom keseluruhan dengan koronavirus kelelawar yang diidentifikasi pada 2013.

Sebuah laporan yang diterbitkan sehari sebelumnya dari Universitas Peking, Universitas Kedokteran Tradisional Cina Guangxi, Universitas Ningbo dan Fakultas Teknik Biologi Wuhan membandingkan bias penggunaan kodon 2019-nCoV dengan “manusia, kelelawar, ayam, landak, trenggiling, dan dua spesies ular” , dan mereka menyimpulkan bahwa “ular adalah reservoir hewan satwa liar yang paling memungkinkan untuk 2019-nCoV” yang kemudian ditransmisikan ke manusia. Pendapat ini telah banyak diperdebatkan: beberapa berpendapat bahwa reservoir harus kelelawar dan inang perantara, burung atau mamalia, bukan ular (seperti ular, tidak seperti manusia, adalah poikilotherms), sementara yang lain menggunakan data tentang rekombinasi dan bias penggunaan kodon SARS / MERS membantah alasannya. Acara rekombinasi yang disebutkan mungkin malah terjadi pada kelelawar.

Studi filogenetik 2019-nCoV meneliti sejarah evolusi virus dan hubungannya dengan organisme lain. Anggota ketujuh dari keluarga coronavirus yang dapat menginfeksi manusia, 2019-nCoV telah dilaporkan memiliki urutan genom 75% hingga 80% identik dengan SARS-CoV dan memiliki lebih banyak kemiripan dengan beberapa coronavirus kelelawar.  Setidaknya lima genom dari coronavirus novel telah diisolasi dan dilaporkan. Hal ini menunjukkan bahwa virus secara genetik berbeda dari coronavirus lain yang dikenal seperti coronavirus terkait sindrom pernafasan parah (SARS-CoV) dan coronavirus terkait sindrom pernafasan Timur Tengah (MERS-CoV). [58] Seperti SARS-CoV, ia adalah anggota dari garis keturunan Beta-CoV B.

Baca  Kenali Deteksi Dini dan Tanda Bahaya DBD

Para peneliti menggunakan analisis kode protein virus corona baru dan membandingkannya dengan kode protein dari virus corona yang ditemukan di inang hewan yang berbeda seperti burung, ular, marmut, landak, kelelawar, dan manusia. Peneliti juga menemukan bahwa kode protein pada 2019-nCoV paling mirip dengan yang ada pada ular. Ular sering berburu kelelawar di alam liar. Laporan menunjukkan bahwa ular dijual di pasar makanan laut lokal di Wuhan, meningkatkan kemungkinan bahwa 2019-nCoV mungkin telah melompat dari spesies inang – kelelawar – menjadi ular dan kemudian ke manusia pada awal wabah koronavirus ini. Namun, bagaimana virus dapat beradaptasi dengan inang berdarah dingin dan berdarah panas masih menjadi misteri.

 

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *

× Konsultasi Whatsapp Obat, Chat Di Sini